O período do desenvolvimento do sistema estomatognático acontece entre a 1ª e 2ª semana de vida intrauterina com o início dos estágios de formação da cavidade bucal e dos dentes.

A odontogênese não pode ser influenciada por deficiências nutricionais relacionadas ao cálcio, ao fosfato e à vitamina A, D e C, bem como ao balanço proteico-energético.

O baixo peso ao nascer não tem relação com a presença de hipoplasias e outros defeitos no esmalte na dentição decídua. As propriedades físicas e químicas dos alimentos interferem na formação e maturação da placa bacteriana, mas não se relacionam com a doença periodontal e a cárie dental.

O esmalte dental é sujeito a influências sistêmicas apenas no seu desenvolvimento, pois após a erupção este interage exclusivamente com fatores locais ambientais, já que é capaz de se remodelar após sua calcificação.

Durante o período de desenvolvimento do sistema estomatognático, o excesso de alguns nutrientes pode ocasionar efeitos na cavidade bucal: o excesso de flúor pode causar a fluorose dental e o excesso de ácido retinoico, vitamina K e E pode trazer malformações craniofaciais e buco-dentais.