Na produção orgânica, é vedada a utilização de qualquer tipo de vacina.

Excepcionalmente, quando for necessária a utilização de medicamentos veterinários na produção orgânica, o período de carência estipulado pela bula do produto deve ser multiplicado pelo fator três ou ampliado de acordo com a instituição certificadora.

A limpeza da sala de ordenha e dos utensílios e equipamentos usados para ordenhar e armazenar o leite deve ser sempre realizada ao final do dia, após a última ordenha.

Durante a ordenha, os três primeiros jatos de leite devem ser descartados, com o propósito de eliminar possíveis grumos ou pus presentes no leite oriundo de vacas com mastite clínica.

Deve-se evitar o fornecimento de alimento para as vacas logo após a ordenha, prevenindo, assim, a ocorrência de doenças metabólicas.