O Reitor e o Vice-Reitor são escolhidos e nomeados pelo Governador do Estado do Paraná.

A função de Pró-Reitor é exercida por servidor integrante do quadro de pessoal da UNICENTRO há, pelo menos, sete anos, designado pelo Governador do Estado.

O corpo discente não é considerado na consulta da comunidade acadêmica para escolha do Reitor e Vice-Reitor.

As Pró-Reitorias são unidades da Reitoria que têm por finalidade planejar, coordenar, executar, orientar e controlar as atividades relativas ao ensino, à pesquisa, à extensão e à administração da universidade.