Entre os testes fenotípicos para o controle genético de camundongos isogênicos, incluem-se identificação dos genes de pigmentação, análise osteométrica e teste de histocompatibilidade e, entre os testes genéticos, destacam-se reação de polimerização em cadeia, eletroforese, filtração molecular, mapeamento de peptídeos e sequenciamento de aminoácidos.