O CBHP pode constituir um obstáculo para o fortalecimento da gestão ambiental, que deve ser centralizada.

O geoprocessamento é uma ferramenta técnica de cartografia sem aplicações na educação ambiental.

Por meio da Resolução CONERH n.º 52/2009, limita-se o quantitativo de representantes por município, de forma a evitar as distorções constatadas no estudo.

A concentração de representantes no Alto Paraguaçu que integram o CBHP pode interferir na tomada de decisão acerca de questões de outorga e cobrança pelo uso dos recursos hídricos.