Um sistema de citometria de fluxo é utilizado para analisar células do sangue em suspensão num solvente aquoso. Esse sistema é capaz de realizar leituras da dispersão frontal de luz, usualmente representada pela sigla FSC, da dispersão lateral, representada por SSC, e da emissão de fluorescência.

Para que o sistema de citometria consiga diferenciar duas populações de células que apresentem tamanho e complexidade similares, é correto realizar a marcação de uma das populações com um fluoróforo.