A diafanização visa interromper o metabolismo celular, estabilizando as estruturas e os componentes químicos intra e extracelulares, preservando e conservando os elementos teciduais.

Em laboratórios de anatomia patológica e de histologia, os aldeídos (formaldeído, glutaraldeído e paraformaldeído) são os agentes mais comumente utilizados no processo de diafanização.

No processo de diafanização é realizada a retirada dos componentes inorgânicos, como fosfato de cálcio presente em tecidos ósseos, em tumores ósseos ou em determinadas patologias.

A diafanização consiste na remoção da água dos tecidos, pois as substâncias que serão posteriormente utilizadas para a inclusão em parafina não se combinam homogeneamente com a água, sendo o álcool etílico a substância comumente utilizada nesta etapa.

No processo de diafanização, o xilol penetra o tecido, em substituição do álcool. A remoção do álcool é de extrema importância, pois a parafina não se mistura homogeneamente com o álcool. Conforme o xilol penetra o tecido, este torna-se mais claro, transparente, e, por essa razão, essa etapa pode ser denominada clarificação.