A hiperplasia tímica por células B correlaciona-se com essa doença na maioria dos casos com indicação de tratamento cirúrgico.

O uso de betabloqueador (via oral ou oftálmico) melhora os sintomas da MG anti-MuSK, e os aminoglicosídeos pioram os sintomas.

A enzima MuSK é ativada pela agrina e direciona a rapsina para aglomerar os receptores de acetilcolina na membrana pós-sináptica.

A timectomia está indicada nos pacientes idosos com MG anti-MuSK, mesmo na ausência de timoma ao exame de imagem.

Ciclofosfamida é o tratamento de primeira escolha, por se tratar de droga citotóxica, e deve ser feito na forma de pulsoterapia mensal.