As micotoxinas proporcionam significativas perdas na produção animal e também são consideradas importantes fontes de riscos para a saúde humana. Esses problemas são variados, desde lesões hepáticas como câncer no fígado, para aflatoxina, e queda nos índices reprodutivos para suínos proporcionados pelas zearalenoma. Entretanto, na prática, são observados alguns problemas frequentes, relacionados com a presença de diferentes níveis de micotoxina encontrados nos alimentos fornecidos para os animais, proporcionando principalmente: