No prontuário de papel existe a dificuldade de recuperar informações importantes para tomada de decisão e/ou obtenção de informações que devem ser compartilhadas entre os profissionais de saúde e com os pacientes.

Desde 2007, o Conselho Federal de Medicina (CFM) autorizou o uso de sistemas informatizados para a guarda e o registro no prontuário eletrônico.

O prontuário eletrônico traz acesso mais veloz ao histórico de saúde e às intervenções às quais o paciente foi submetido; legibilidade absoluta das informações; eliminação da redundância de dados e de pedidos de exames complementares; flexibilidade do layout dos dados diferenciando o exposto ao profissional e ao que o paciente não pode ter acesso; informações organizadas de forma mais sistemática; facilidade na coleta dos dados para emissão de relatórios.