A Conjugação refere-se à transferência de genes de uma célula para a outra, utilizando um fago como vetor, sem contato entre as células.

Na Conjugação Generalizada, ocorre a clivagem do cromossomo, induzida pelo fago e, acidentalmente, fragmentos, ao acaso do DNA bacteriano, são encapsulados pelas proteínas do capsídeo no lugar do DNA do fago.

O processo de Transdução exige que a célula doadora contenha um pili sexual que irá estabelecer o contato com os sítios receptores, resultando na formação de um par de células relativamente estável e no início da transferência do DNA.

Na Conjugação Especializada, somente determinados genes, localizados nos cromossomos próximos ao local de inserção do profago, são transferidos. O fago adquire os genes bacterianos por um evento raro de excisão anormal no cromossomo bacteriano.

A Transformação é a transferência de genes somente de DNA de uma célula para outra, a capacidade da célula se transformar depende de um estado fisiológico celular transitório que permite a passagem do DNA através da membrana, funcionando melhor quando as células doadoras receptoras são intimamente relacionadas.