O cloro, na forma do gás cloro ou hipoclorito, adicionado à água, visa destruir ou inativar os organismos alvo.

A cloração é um método de simples aplicação, porem exige alto custo e, não muito confiável.

A água a ser distribuída para a população não deve conter teor de cloro residual. Deste modo, previne nova contaminação durante o processo de distribuição.

No Brasil, de acordo com a Portaria n. 518, de 2004, do Ministério da Saúde / ANVISA, a água é considerada potável, sob o ponto de vista microbiológico, quando está de acordo com a seguinte conformidade: ausência de cloração e termotolerantes em 100 ml de amostra de água para consumo, considerando-se assim inofensiva para a saúde do homem.