Durante a lactação, a mãe em tratamento para depressão pós-parto deve evitar o uso de fluoxetina, pois seu metabólito ativo tem meia-vida longa e pode atingir altos níveis plasmáticos no bebê, o que resulta em efeitos adversos nos lactentes, como diarreia, cólicas e diminuição do sono e do apetite. Nesse período, é recomendável o uso de sertralina, nortriptilina e paroxetina em substituição à fluoxetina.