Nas amostras lisas, o LPS lipídio A é formado por uma longa cadeia de ácido graxo, presença de região central com manose, glicose, quinovosamina e glucosamina, além de açúcares não definidos, e a parte hidrofílica do LPS contém cadeia O.

Nas amostras lisas, o LPS lipídio O está ausente ou reduzido a poucos resíduos, sendo a especificidade determinada pelo polissacarídio manose e glicose.

Nas amostras rugosas, podem apresentarse os lipídios C ou D, e a parte hidrofóbica do LPS contém a cadeia A.

Nas amostras rugosas, uma parte hidrofílica do LPS com cadeia A é formada por ligações alfa 1-2 ou alfa 1-2 mais alfa 1-3.

As amostras lisas e rugosas apresentam parte hidrofóbica do LPS, com presença de cadeia O formado por ligações beta 1-2.