Os pólipos hamartomatosos da síndrome de Peutz- -Jeghers são morfologicamente indistinguíveis dos pólipos juvenis, mas diferem por não apresentarem risco aumentado de malignidade extraintestinal.

Os pólipos hiperplásicos apresentam células caliciformes e absortivas maduras, arquitetura de superfície serrilhada e mutações frequentes em STK11, características que os distinguem dos adenomas tradicionais.

A polipose juvenil autossômica dominante tem como alteração comum associada à mutação do SMAD4. Morfologicamente, observam-se dilatações císticas glandulares, preenchidas com mucinas e restos infamatórios.

A síndrome da úlcera retal solitária leva à formação de pólipos serrilhados típicos, cuja principal característica histológica é a dilatação cística glandular associada à arborização do músculo liso.

A maioria dos pólipos juvenis apresenta-se ao diagnóstico com atipia epitelial, razão pela qual a colectomia é indicada, mesmo na ausência de sangramento.