A DEP (diferença esperada na progênie) é uma medida da diferença entre o desempenho médio da progênie de um determinado animal (touro/vaca) com a progênie de outro animal considerado. Ela é todo o valor genético de um animal e um instrumento de comparação que auxilia no processo de seleção.

A acurácia, no melhoramento genético, indica o grau de confiabilidade da DEP (diferença esperada na progênie), é sinônimo de precisão absoluta e não sofre alteração com o aumento do número de informações. Quanto mais o touro é provado, por meio do valor genético e do desempenho de seus filhos para a característica de interesse, aumenta-se a acurácia pelo ajuste da DEP, tornando-a mais confiável.

No processo de seleção, as características de interesse zootécnico, como taxa de crescimento, ganho de peso, peso ao desmame, característica de carcaça, entre outros, que são quantitativas, envolvem a transmissão de muitos genes, são poligênicas, altamente influenciáveis pelo ambiente (clima, alimentação, manejo, etc.). Assim, para melhorar, por exemplo, o peso médio dos bezerros ao sobreano no plantel, não será rápido, normalmente o aperfeiçoamento será gradual, distribuído ao longo de gerações, uma vez que envolve muitos pares de genes, com interação entre os genes.

As características qualitativas de bovinos envolvem muitos genes (monogênicas) e são influenciáveis pelo meio ambiente. Características importantes para a bovinocultura não podem ser corrigidas com a simples exclusão do animal que apresenta as características indesejáveis do plantel. Por exemplo, cor da pele, o caráter mocho ou aspado (chifrudo), nanismo, albinismo, hipoplasia testicular e criptorquidismo.

A endogamia tem por efeito principal o aumento da homozigose, que leva ao aumento do vigor dos animais, principalmente para as características reprodutivas, aumentando o número de animais produzidos e o retorno econômico da atividade, e ajuda também a diminuir o aparecimento de defeitos genéticos relacionados a genes com alelo recessivo deletério.