Redução da absorção de glicose no estômago, devido à inibição das bombas de sódio dependentes de GLUT-4.

Prejuízo na absorção de ferro, cálcio e folato, especialmente no jejuno e íleo, por destruição das células produtoras de ácido clorídrico.

Comprometimento da absorção de nutrientes, sobretudo no duodeno e jejuno, resultando em má absorção de ferro e folato.

Diminuição da absorção de proteínas, pois o glúten inibe diretamente a ação da pepsina no estômago.

Incapacidade de absorver lipídios, exclusivamente por ausência total de sais biliares.