A pesquisa científica independe de autorização prévia do órgão responsável pela administração da unidade e está restrita exclusivamente às condições e restrições estabelecidas pelo plano de manejo da unidade.

As Estações Ecológicas possuem, como características, posse e domínio privados, sendo que as áreas particulares incluídas em seus limites serão incorporadas, de acordo com o que dispõe em lei específica.

As Estações Ecológicas proíbem alterações dos ecossistemas em casos que objetivem o manejo de espécies com o fim de preservar a diversidade biológica.

É permitida a visitação pública aberta, sobretudo aquelas que possuem objetivo educacional, corroborando o Plano de Manejo da unidade ou regulamento específico.

Nas Estações Ecológicas são permitidas alterações dos ecossistemas no caso de medidas que visem à restauração de ecossistemas modificados.