Os antimicrobianos classificados como “Criticamente Importantes de Mais Alta Prioridade”, como as fluoroquinolonas e as cefalosporinas de 3ª e 4ª gerações, devem ter seu uso restrito na medicina veterinária, sendo desencorajado o seu uso preventivo.

A profilaxia rotineira com antimicrobianos de amplo espectro é recomendada em lotes de aves e suínos durante fases críticas de estresse (como o desmame), independentemente da presença de sinais clínicos, visando assegurar a produtividade.

O uso de antimicrobianos como promotores de crescimento é incentivado pela OMS, desde que as doses sejam subterapêuticas, pois isso minimiza a pressão de seleção sobre a microbiota intestinal dos animais.

A metafilaxia é definida como o tratamento de animais sadios que não tiveram contato com animais doentes, sendo uma prática equivalente à quimioprofilaxia individual, com o objetivo de erradicar patógenos comensais.

A escolha do antimicrobiano na produção de ruminantes deve basear-se exclusivamente no menor período de carência e no custo do medicamento, visto que a barreira ruminal impede a transferência de genes de resistência para patógenos humanos.