Em última análise, as interações estabelecidas entre os aminoácidos componentes de uma dada cadeia polipetídica irão, em conjunto com outros fatores, definir a estrutura tridimensional que a cadeia irá assumir em solução. A determinação desta estrutura pode, em muitas das vezes, auxilar a compreensão do mecanismo de ação desta cadeia polipeptídica, e permitir o esclarecimento de suas funções em um determinado organismo que a produz. Assinale abaixo a afirmativa que não expressa uma estratégia experimental aplicável para a caracterização da estrutura tridimensional das cadeias polipeptídicas.

Diferentes métodos de detecção de proteínas vem sendo desenvolvidos e adaptados visando o aprimoramento, a modernização e a simplificação do processo de detecção de proteínas. No desenvolvimento e na adaptação de um novo método para análise proteômica, assinale a alternativa incorreta é incorreto afirmar que são características desejáveis:

Visando a caracterização de uma via de transdução de sinal, mediada por um novo hormônio, um pesquisador foi encarregado de isolar mutantes defectivos na percepção deste hormônio, e que desta forma pudessem ser úteis na caracterização desta via de sinalização. Uma vez que este hormônio induzia o alongamento das células, o pesquisador desenvolveu um método de seleção de mutantes baseado na identificação de células que apresentassem alterações no processo de elongação celular. Após a realização deste experimento, foram isolados dez mutantes com características de elongação alterada. Buscando selecionar dentre estes dez mutantes os que melhor serviriam para caracterizar a via de transdução de sinal, o pesquisador realizou um segundo experimento, no qual o hormônio em questão foi aplicado nas culturas celulares mutantes. A tabela abaixo representa os resultados obtidos nestes dois experimentos.



Com base nestes resultados, foram formuladas as seguintes afirmativas.

I. Os mutantes 1, 3 e 7 correspondem aos mutantes na via de transdução de sinal do hormônio.

II. Os mutantes 2, 4, 5 e 6 correspondem aos mutantes na via de biossíntese do hormônio.

III. Os mutantes 1, 3 e 7 correspondem aos mutantes na via de biossíntese do hormônio.

IV. Os mutantes 2, 4, 5 e 6 correspondem aos mutantes na via de transdução de sinal do hormônio.

V. Os mutantes 8, 9 e 10 correspondem a mutantes que produzem níveis elevados do hormônio, mas que não apresentam alteração da sinalização.

Assinale:

Com relação à espectrometria de massa, assinale a alternativa incorreta.

Nos experimentos de análise proteômica, comumente são utilizados, sequencialmente, uma fonte de ionização de peptídeos seguida de um analisador de massa. Assinale a alternativa que apresenta exemplos dos dois tipos de aparelhos.

Sobre resolução espectrométrica dos aparelhos de determinação de massas, analise as afirmativas a seguir.

I. A largura do pico detectado (avaliada na sua base), dividida pela massa do pico, define a resolução espectrométrica de um aparelho de determinação de massa.

II. A introdução do sistema Orbitrap aumentou bastante a resolução espectrométrica em relação aos sistemas IonTraps simples, anteriormente utilizados.

III. Quanto maior a resolução espectrométrica, maior a chance de mais de um peptídeo serem agrupados em um mesmo pico.

IV. Uma alta resolução espectrométrica é uma pré-condição para a identificação e quantificação acurada dos peptídeos.

Assinale:

Trabalhando com o isolamento de um gene de humanos, um pesquisador desenvolveu duas estratégias de clonagem, utilizando como sonda um gene homólogo isolado de camundongos. Na primeira delas, ele utilizou como material inicial o DNA extraído de culturas de células de fibroblastos, resultando na obtenção do clone A. Na segunda abordagem, ele utilizou uma preparação de RNA mensageiro de células renais, resultando na obtenção do clone B. Considere ambas as estratégias bem sucedidas que possibilitaram a clonagem do mesmo gene.

Experimento 1 – caracterização dos elementos que regulam a expressão tecidual do gene.

Experimento 2 – expressão do gene em bactérias para purificação da proteína codificada pelo gene isolado.

Experimento 3 – isolamento de genes de proteínas que interagem com a proteína codificada pelo gene isolado através do sistema Duplo Híbrido em leveduras.

Selecione o clone que deverá ser utilizado, respectivamente, para cada um dos experimentos listados acima.

Assinale abaixo a alternativa que apresenta apenas exemplos de proteínas com estrutura quaternária.

Os RNAs mensageiros eucariontes apresentam diferentes regiões, cada uma deles com funções específicas durante o tempo de vida desta molécula. Assinale a alternativa que contém as principais funções das regiões 5' e 3' de um RNA mensageiro:

A abordagem proteômica tem possibilitado a caracterização de grandes quantidades de proteínas que estão presentes em condições fisiológicas definidas. Dentre as diferentes estratégias experimentais utilizadas, a proteômica de organelas foi uma das primeiras abordagens que disponibilizaram importantes conjuntos de dados, criando a expectativa de que o conjunto completo de proteínas que compõe as diferentes organelas de uma célula eucarionte pudesse ser caracterizado. Entretanto, análises realizadas com proteomas de cloroplastos e mitocôndrias têm demonstrado que, apesar dos grandes avanços alcançados, ainda não é possível a identificação de todas as proteínas que compõem estas organelas. Sobre tais iniciativas, analise as afirmativas a seguir.

I. A análise do proteoma de uma organela é limitada em função da perda de proteínas durante o processo de preparação das amostras.

II. O alto grau de conservação entre proteínas presentes em cloroplastos e mitocôndrias, assim como sua conservação com proteínas presentes em outros compartimentos celulares, dificulta a identificação das mesmas nos proteomas organelares.

III. Proteínas de membrana estão sempre representadas em baixa proporção, o que limita a identificação destas na abordagem proteômica.

IV. Proteínas destas organelas sofrem proteólise durante seu processo de importação para as organelas, o que limita sua identificação final.

Assinale: